Trong tổng cộng 8 lần gặp nhau giữa 2 đội tuyển Việt Nam và Malaysia tại các kỳ AFF Cup, đội tuyển Việt Nam có 4 trận thắng, 3 trận thua, hoà nhau 1 lần. Tuy nhiên, chúng ta thường chỉ thắng Malaysia ở vòng bảng, vào đến giai đoạn knock-out, họ lại thắng chúng ta.
Tuy nhiên, xét về tính chất cũng như chất lượng các trận thắng, Malaysia lại là đội nhỉnh hơn trong các lần đối đầu mang tính quyết định giữa đôi bên. Cụ thể, đội bóng xứ Mã thường biết cách thắng đội tuyển Việt Nam ở giai đoạn knock-out tại các kỳ AFF Cup, trong khi đội tuyển Việt Nam chủ yếu chỉ thắng Malaysia ở vòng bảng.
Năm 1998, đội tuyển Việt Nam khi đó có lợi thế sân nhà thắng Malaysia 1-0 tại vòng bảng trên sân Hàng Đẫy, với bàn thắng duy nhất thuộc về cựu danh thủ Nguyễn Hồng Sơn.
Năm 2002, đội tuyển Việt Nam của HLV Calisto trong giai đoạn chuyển giao lực lượng có chiến thắng 2-1 trước Malaysia ở trận tranh hạng ba. Đấy cũng là lần duy nhất tính cho đến thời điểm hiện tại, đội tuyển Việt Nam vượt qua đội bóng xứ Mã ở giai đoạn knock-out, tại một kỳ AFF Cup.
Những người ghi bàn cho đội bóng của HLV Calisto khi đó là Nguyễn Minh Phương và Trần Trường Giang, các ngôi sao sau này của bóng đá Việt Nam.
Nhưng chỉ đúng 2 năm sau đó, Malaysia “đòi nợ” tại AFF Cup 2010. Ở trận bán kết lượt đi trên sân Bukit Jalil tại Kuala Lumpur, tiền đạo Safee Sali ghi cả 2 bàn thắng giúp Malaysia thắng 2-0. Trong đó, bàn đầu tiên đến từ pha bắt bóng hụt không thể tin nổi của thủ môn Bùi Tấn Trường bên phía đội tuyển Việt Nam.
4 năm sau, tại AFF Cup 2014, Malaysia và Việt Nam lại gặp nhau tại bán kết một kỳ giải AFF Cup. Đội tuyển Việt Nam giành chiến thắng 2-1 đầy bất ngờ trong trận lượt đi ở sân Shah Alam (Selangor – Malaysia), nhưng lại thua trận lượt về 2-4 còn bất ngờ hơn trên sân Mỹ Đình. Chung cuộc, đội tuyển Việt Nam của HLV Miura thua 4-5 sau 2 lượt trận.
Trong số 4 trận thắng của đội tuyển Việt Nam trước Malaysia, chúng ta chỉ thắng 1 lần ở giai đoạn knock-out (trận tranh hạng ba năm 2002), 3 trận thắng kia toàn ở vòng bảng. Ngược lại, cả 3 chiến thắng của Malaysia trước đội tuyển Việt Nam qua các thời kỳ đều là thắng ở giai đoạn knock-out.
Các cuộc đối đầu giữa đội tuyển Việt Nam và Malaysia tại AFF Cup
1998:Thắng
Vòng bảng: Việt Nam – Malaysia: 1-0
2000:Hòa và thua
Vòng bảng: Việt Nam – Malaysia: 0-0
Tranh hạng ba: Việt Nam – Malaysia: 0-3
2002:Thắng
Tranh hạng ba: Việt Nam – Malaysia: 2-1
2008:Thắng
Vòng bảng: Việt Nam – Malaysia: 3-2
2010:
Bán kết: Hòa và Thua
Lượt đi: Malaysia – Việt Nam: 2-0
Lượt về: Việt Nam – Malaysia: 0-0
(Chung cuộc Malaysia thắng 2-0)
2014
Bán kết: Thắng và thua
Lượt đi: Malaysia – Việt Nam: 1-2
Lượt về: Việt Nam – Malaysia: 2-4
(Chung cuộc Malaysia thắng 5-4)
2016: Thắng
Vòng bảng: Việt Nam – Malaysia: 1-0